O NUDATEF possui uma estrutura que suporta a pesquisa, desenvolvimento e inovação (P,D&I) em produtos naturais (obtenção, identificação e avaliação de propriedades biológicas), e as ações realizadas nele são pautadas pelas políticas públicas de saúde e projetos estruturadores do estado de Pernambuco. Desta forma, atua através das seguintes abordagens: padronização química (fingerprints); prospecção de moléculas ou frações ativas; identificação e elucidação estrutural de produtos naturais; controle de qualidade (métodos analíticos: UV; CLAE; CG); tecnologia farmacêutica (padronização de extrativos vegetais; desenvolvimento de formas farmacêuticas contendo elevado teor de derivados vegetais; e, desenvolvimento/otimização de processos).

A área destinada ao núcleo é de aproximadamente 80 m2 com bancadas laterais e uma bancada central de 10 m2 (2 x 5 m), cuja infraestrutura conta com os seguintes equipamentos: